Бесплатное ПО от ibidi для анализа данных экспериментов с хемотаксисом. ПО Chemotaxis and Migration Tool разработано на основе системы обработки данных ImageJ от NIH и может использоваться как автономное ПО или в качестве плагина для ImageJ. ПО предоставляет различные графики и статистические данные, которые позволяют провести расширенный анализ экспериментов с хемотаксисом.
Применения
Применения
Анализ изображений и интерпретация данных экспериментов c хемотаксисом и миграцией;
Количественная оценка анализа хемотаксиса 2D и 3D
Статистические данные
CT-Exp. (+/-)
Contr. 1 (-/-)
Contr. 2 (+/+)
Центр масс x [мкм]
-4.0
3.6
-7.6
Центр масс y [мкм]
176.3
18.1
-3.1
Центр масс length [мкм]
176.4
18.5
8.2
xFMI (индекс миграции)
-0.014
0.015
-0.004
yFMI (индекс миграции)
0.280
0.035
-0.007
Прямолинейность D
0.33
0.16
0.21
Среднее евклидово расстояние [мкм]
208.9
65.8
145.8
Среднее накопленное расстояние [мкм]
617.1
411.8
716.4
Скорость клеток [мкм/мин]
0.43
0.29
0.49
Тест Рэлея
< 0.05
>0.05
>0.05
Chemotaxis of slow migrating mammalian cells analysed by video microscopy R Zantl, E Horn - Cell Migration, 2011 - Springer
μ-Slide Chemotaxis: a new chamber for long-term chemotaxis studies P Zengel, A Nguyen-Hoang, C Schildhammer, R Zantl… - BMC cell biology, 2011 - Springer
The trafficking protein JFC1 regulates Rac1‐GTP localization at the uropod controlling neutrophil chemotaxis and in vivo migration M Ramadass, JL Johnson, A Marki… - Journal of leukocyte …, 2019 - Wiley Online Library
Low and moderate doses of ionizing radiation up to 2 Gy modulate transmigration and chemotaxis of activated macrophages, provoke an anti‐inflammatory cytokine … R Wunderlich, A Ernst, F Rödel… - Clinical & …, 2015 - Wiley Online Library
Real-time imaging reveals that P2Y2 and P2Y12 receptor agonists are not chemoattractants and macrophage chemotaxis to complement C5a is … K Isfort, F Ebert, J Bornhorst, S Sargin… - Journal of Biological …, 2011 - Elsevier
Chemokine‐triggered microtubule polymerization promotes neutrophil chemotaxis and invasion but not transendothelial migration SK Yadav, D Stojkov, SW Feigelson… - Journal of leukocyte …, 2019 - Wiley Online Library
The role of calpain enzyme on neutrophils chemotaxis ability A Zainol, MR Jais, EN Ismail, R Ishak
Exosome secretion promotes chemotaxis of cancer cells BH Sung, AM Weaver - Cell adhesion & migration, 2017 - Taylor & Francis
Serum amyloid A chemoattracts immature dendritic cells and indirectly provokes monocyte chemotaxis by induction of cooperating CC and CXC chemokines M Gouwy, M De Buck, N Pörtner… - European journal of …, 2015 - Wiley Online Library
Advanced 2D/3D cell migration assay for faster evaluation of chemotaxis of slow-moving cells L Tomasova, Z Guttenberg, B Hoffmann, R Merkel - PLoS One, 2019
Характеристики
Chemotaxis and Migration Tool
Chemotaxis and Migration Tool от ibidi - это плагин ImageJ. Он находится в свободном доступе и не зависит от платформы ImageJ, что означает, что инструмент может работать во всех основных операционных системах. Это ПО предоставляет различные графики и статистические данные, которые позволяют проводить расширенный анализ экспериментов.
После отслеживания клеток их пути можно построить и проанализировать на предмет хемотаксических эффектов. Простая в использовании система калибровки микроскопа обеспечивает доступ к множеству параметров. Для специфического анализа доступны секторные инструменты, которые подсчитывают клетки в угловых или круговых областях, известные как графики Роуза.
Все расчеты можно сразу визуализировать с помощью гистограмм и других диаграмм. При желании все данные можно экспортировать для дальнейшего анализа. Имея полный набор данных о миграции, пользователь может количественно оценить хемотаксис и случайную миграцию. Chemotaxis and Migration Tool вместе с о слайд-камерами для хемотаксиса µ-Slide от ibidi позволяет пользователям детально анализировать влияние лекарств на хемотаксическое поведение клеток.
Windows: Загрузите ChemotaxisAndMigrationTool.zip на свой компьютер, разархивируйте и запустите ReleaseChemotaxis.exe.
Linux: Скомпилируйте исходный код в целевую систему.
Описание
Это ПО представляет собой бесплатный инструмент для анализа хемотаксических или миграционных данных, полученных с помощью видеомикроскопии. Он предназначен для слайд-камерµ-Slide Chemotaxis 2D и µ-Slide Chemotaxis 3D от ibidi для визуального анализа хемотаксиса или аналогичных экспериментальных данных.
Пример данных
Данный пример экспериментальных данных предназначен для первого использования и работает с обеими версиями ПО Chemotaxis and Migration Tool. Вы можете запросить пример экспериментальных данных у менеджера.
Плагин встроен в ImageJ 1.37 и протестирован в Windows XP, MAC OS и Suse Linux 9.0.
Установка
Загрузите плагин в папку плагинов ImageJ и перезапустите ImageJ. Чтобы запустить плагин, перейдите в меню плагинов ImageJ.
Мы также рекомендуем использовать плагин для отслеживания клеток Manual Tracking
Описание
Это ПО представляет собой бесплатный инструмент для анализа хемотаксических или миграционных данных, полученных с помощью видеомикроскопии. Он предназначен для слайд-камерµ-Slide Chemotaxis 2D и µ-Slide Chemotaxis 3D от ibidi для визуального анализа хемотаксиса или аналогичных экспериментальных данных.
Пример данных
Данный пример экспериментальных данных предназначен для первого использования и работает с обеими версиями ПО Chemotaxis and Migration Tool. Вы можете запросить пример экспериментальных данных у менеджера.
Товар бывает в наличии на нашем складе в РФ крайне редко. Из-за высокой стоимости и специфических характеристик высокотехнологического оборудования в большинстве случаев оно отсутствует и на складе самого производителя, так как производится под конкретный заказ.
Недорогие расходные материалы и дополнительные комплектующие, пользующиеся популярностью, производятся в значительном количестве и могут быть отправлены нам нашими поставщиками в течение пары дней после получения оплаты по инвойсу.
1. Наличие товара на складе производителя и срок его производства;
Если товара нет на складе производителя, срок производства высокотехнологичного оборудования, как правило, составляет от трех до шести недель. Производство сложных комплексных систем может занимать больше времени.
2. Время на доставку груза в РФ;
Срок доставки груза в РФ зависит от его веса и габаритов. Если груз небольшой, то он летит самолетом, что занимает один-три дня до таможенного склада. Если вес груза измеряется сотнями килограммов, то он плывет кораблем в пределах месяца.
3. Срок прохождения таможенного контроля.
Данный этап занимает до 10 дней. В случае непредвиденных обстоятельств процесс таможенного оформления может затянутся на месяц и больше.
Срок поставки комплектующих Thorlabs занимает от 4 недель.