ThorImageLS - это программа для регистрации изображений с открытым исходным кодом, которая позволяет управлять системой гиперспектральной визуализации Thorlabs на базе микроскопов Cerna®, а также мультифотонным микроскопом Bergamo II и конфокальными микроскопами. Данное ПО также контролирует дополнительное внешнее оборудование.
ThorImageLS предоставляет интегрированное модульное рабочее пространство, адаптированное к индивидуальным потребностям ученого. Его интерфейс, ориентированный на рабочие процессы, поддерживает получение, визуализацию и анализ отдельных изображений, Z-стеков, временных рядов и потоковых изображений. ThorImageLS входит в комплект поставки микроскопа Thorlabs и обладает открытым исходным кодом, что позволяет полностью настраивать функции и производительность программного обеспечения.
Компания Thorlabs обеспечивает постоянную поддержку клиентов и регулярные обновления программного обеспечения для удовлетворения изменяющихся потребностей научного сообщества в области визуализации. Краткое описание функций, используемых с системой гиперспектральной визуализации, приведено ниже; Для получения дополнительной информации об основных функциях ThorImageLS, пожалуйста, загрузите нашу брошюру (вкладка "Документы").
ПО для задач:
|
Расширенный функционал ПО:
- Настраиваемое рабочее пространство;
- Регистрация изображений, синхронизированная с входами
оборудования и разными временными событиями;
- Коррекция изображений в режиме реального времени и анализ ROI;
- Многопользовательские настройки, сохранение для общих рабочих станций.
|
Регистрация изображений
Как показано на скриншоте вкладки Capture, начальная длина волны настраиваемого фильтра Kurios, длина волны остановки и размер шага длины волны могут быть установлены в зависимости от потребностей эксперимента.
Поскольку пропускная способность перестраиваемого фильтра зависит от длины волны, программное обеспечение позволяет использовать различную экспозицию на каждом шаге длины волны; пользователь может установить несколько значений экспозиции вручную, как показано красными точками на графике; эта кривая интерполируется для значений экспозиции на промежуточных шагах длины волны.
Просмотр и анализ результатов
ПО ThorImageLS отображает записанный гиперспектральный набор данных в области просмотра. Ползунок на панели управления в левой части экрана показывает длину волны текущего изображения и позволяет пользователю прокручивать набор длин волн, чтобы увидеть каждое монохромное изображение. Панель «info» позволяет быстро просмотреть все настройки регистрации изображения, использованные для эксперимента. Эти функции позволяют легко проверять изображения и подтверждать настройки сразу после завершения получения.
Изображения могут быть сохранены в стек TIFF файлов для анализа с ImageJ или MATLAB. Если выбран необработанный формат (raw), данные могут быть проанализированы с помощью ПО Scyven, которое является бесплатным программным обеспечением. Scyven включает в себя возможность просмотра спектров для пикселя или области, обнаружения материалов в образце (более подробно ниже) и классификации образцов с использованием пользовательской спектральной библиотеки.
Панель просмотра результатов